El modelo de gestión del centro incluye la administración del mismo por parte de la EPN y
la SENESCYT, a través de un directorio conjunto. El centro está adscrito a la EPN pero
tiene un carácter nacional, lo que implica que investigadores de otras instituciones de
educación superior e institutos públicos de investigación pueden trabajar en proyectos de
investigación en las áreas de competencia del centro.
El máximo organismo de nivel directivo del Centro de Modelización Matemática es su Directorio, el cual está integrado por:
Presidente: Dr. Diego Fernando Recalde Calahorrano, Jefe de Departamento de Matemática de la EPN, en calidad de delegado del Rector/a
Delegada permanente de la Secretaría de Educación Superior, Ciencia, Tecnología e Innovación: Mgs. Cecilia Alexandra Santana Estrada.
Representante electo del personal académico
e investigadores Modemat: Dr. Luis Miguel Torres Carvajal.
Secretario del Directorio: Dr. Juan Carlos De Los Reyes Bueno.